Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A8Q9Y2E8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A8Q9Y2E8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms