Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms