Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNPO2Q9UMS6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms