Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms