Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP8AP2Q9UKL3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms