Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms