Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC6Q9UBN7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC6Q9UBN7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms