Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNMT3BQ9UBC3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms