Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN3Q9P1Z3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms