Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms