Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPAQ9P0L0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAPAQ9P0L0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms