Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBP1Q9NZI7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBP1Q9NZI7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBP1Q9NZI7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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