Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNIP1Q9NZI2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP1Q9NZI2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms