Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms