Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF38Q9NXL2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.6 ms