Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM260Q9NX78 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM260Q9NX78 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms