Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB20Q9NX57 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB20Q9NX57 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms