Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3EQ9NVU0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms