Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INTS9Q9NV88 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
INTS9Q9NV88 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms