Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF275Q9NSD4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF275Q9NSD4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms