Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SERINC1Q9NRX5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC1Q9NRX5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms