Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TULP4Q9NRJ4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TULP4Q9NRJ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms