Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRC4Q9NPP4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms