Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX4

TRPC7, Short transient receptor potential channel 7, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC7Q9HCX4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TRPC7Q9HCX4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC7Q9HCX4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms