Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XAB2Q9HCS7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms