Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA4Q9HCM2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms