Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC52A2Q9HAB3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC52A2Q9HAB3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms