Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf42Q9H799 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C5orf42Q9H799 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms