Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms