Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMG9Q9H0W8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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