Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLIRPQ9GZT3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLIRPQ9GZT3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms