Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PacrgQ9DAK2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms