Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms