Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM79Q9BSE2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms