Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF8Q9BRL6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF8Q9BRL6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms