Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX50Q9BQ39 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms