Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms