Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SIN3AQ96ST3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIN3AQ96ST3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms