Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf72Q96LT7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf72Q96LT7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms