Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF479Q96JC4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms