Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIC2Q96JB3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms