Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms