Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms