Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD2Q96BF3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms