Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MKL1Q969V6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKL1Q969V6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms