Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATA6Q92908 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATA6Q92908 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATA6Q92908 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATA6Q92908 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GATA6Q92908 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms