Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms