Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIPC3Q8TF64 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms