Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms