Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM35BQ8NCS4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM35BQ8NCS4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms